Распределение кабарги внутри огромного ее ареала очень мозаично. Встречаются изолированные микроареалы площадью от 6—8 до 100 км2 и более. Это зависит от характера распространения древесных лишайников и условий обитания.

На примере горных систем Восточного и Западного Прибайкалья четко видна зависимость микроареалов кабарги от характера распространения темнохвойной тайги. В этих районах микроареалы кабарги приурочены к крутым горным склонам, поросшим густым, старым темнохвойным лесом, с выходами скал, вкраплениями светлохвойных участков леса по речным террасам и обусловлены наличием труднопроходимых участков ветровала и густого подроста, который вместе с обильным подлеском создает плотные заросли. Этим же характеризуются местообитания кабарги на Алтае и в Приморье.

На отдельных, иногда обширных территориях ареала кабарга обитает в почти чистых лиственничниках с подлеском из рододендрона даурского и других кустарников. Таковы местообитания на Витимском плоскогорье в Бурятии, а также на значительной части Якутии.

Поскольку распределение кабарги тесно связано с темнохвойным лесом, изменение границ ареала в историческом аспекте должно было соответствовать изменениям площадей, занятых этой тайгой. Так, темнохвойный лес на Баргузинском хребте в прошлом имел более широкое распространение, а в верхних частях лесного пояса на склонах южной экспозиции, там, где теперь господствует сосна, были сплошные темно-хвойные леса. Вместе с отступлением этих лесов дробился и сокращался ареал кабарги, что наблюдается и сейчас в местах, где пожары уничтожают таежные массивы.